يقوم المرصد المغربي للسجون بتنفيذ عدة برامج و مشاريع في إطار الاتفاقيات والشراكات المؤسسية والمالية مع مختلف المنظمات والمؤسسات والإدارات على المستويين الوطني والدولي وبصفة خاصة مع:

• • المندوبية العامة لإدارة السجون وإعادة الإدماج http://www.dgapr.gov.ma/Pages/Accueil.aspx ؛
  • وزارة العدل http://www.justice.gov.ma/ ؛
  • المجلس الوطني لحقوق الإنسان https://www.cndh.org.ma/fr ؛
  •  المندوبية الوزارية المكلفة بحقوق الإنسان https://didh.gov.ma  ؛
  • الوكالة الإسبانية من أجل التعاون الدولي  https://www.aecid.ma/la-aecid-en-marruecos/ ؛
  • مندوبية الاتحاد الأوروبي https://eeas.europa.eu/delegations/morocco_fr ؛
  • المنظمة الدولية للإصلاح الجنائي  https://www.penalreform.org/ ؛
  • منظمة المجتمع المفتوح https://www.opensocietyfoundations.org/ .

بالإضافة إلى ذلك ينسق المرصد المغربي للسجون وينفذ العديد من المبادرات والأنشطة مع مختلف الشركاء الجمعويين:

• الائتلاف العالمي من أجل إلغاء عقوبة الإعدام؛ http://www.worldcoalition.org
• المنتدى  المغربي من أجل الحقيقة والإنصاف؛
• منظمة العفو الدولية فرع المغرب؛   https://www.amnesty.ma
• المنظمة المغربية لحقوق الإنسان؛      www.omdh.ma
• شبكة المحاميات والمحامين ضد عقوبة الإعدام؛
• شبكة البرلمانيات والبرلمانيين ضد عقوبة الإعدام؛
• جمعية هيآت المحامين بالمغرب؛    http://www.abam.ma
• الجمعية الوطنية للمحامين الشباب بالمغرب؛ anjam.ma
• جمعية عدالة من أجل الحق في محاكمة عادلة؛ http://www.justicemaroc.org
• الجمعية المغربية لحقوق الإنسان؛    http://www.amdh.ma
• الجمعية المغربية لتأهيل ضحايا التعذيب؛ https://amrvt.wordpress.com
• الجمعية الديمقراطية لنساء المغرب؛ http://www.adfm.ma
• الرابطة الديمقراطية لحقوق المرأة؛ http://www.flddf.org
• الجمعية المغربية لحقوق المرأة؛  http://amdf.over-blog.com
• التنسيقية المغاربية لمنظمات حقوق الإنسان؛ http://cmodh.org
• مركز دراسات حقوق الإنسان والديمقراطية؛ http://beta.cedhd.org/cedhd
• الجمعية المغربية لمحاربة داء السيدا؛  http://www.alcs.ma
• جمعية حلقة وصل سجن – مجتمع؛  http://www.relais.ma
• مؤسسة محمد السادس لإعادة إدماج السجناء؛
• جميعا ضد عقوبة الإعدام؛      http://www.ecpm.org
• المنظمة الايطالية بروجيتو موندو بالمغرب https://www.progettomondomlal.org
• جمعية الشباب لأجل الشباب http://ajj.org.ma/
• الجمعية الوطنية للتقليص من مخاطر المخدرات فرع فاس https://www.facebook.com/rdrmarocfes
• جمعية حلقة وصل سجن مجتمع https://relais.ma